เด็กชายเน็ทโตะ ฮิคาริ และคู่หูวงศ์วานเน็ตนำวท์ ร็อคแมน ต้องเผชิญหน้ากับองค์กรชั่วร้าย ที่วางแผนใช้เทคโนโลยีเน็ตนำวท์และคลื่นแม่เหล็กไฟฟ้าควบคุมโลก เน็ทโตะและร็อคแมนต้องร่วมมือกับเพื่อนๆ ปกป้องโลกจากแผนการอันชั่วร้าย ผ่านการต่อสู้ในโลกไซเบอร์และโลกจริง